Prestations de séquençage
CNRS Délégation Occitanie Est
L'objet du présent accord-cadre est de produire des ressources génétiques et des ensembles de données pour les espèces Timema. Il comprend le reséquençage de génomes entiers (WGRS), la production de plusieurs génomes de référence, le séquençage de mécanismes épigénétiques et le génotypage par séquençage (ddRAD) de phasmes du genre Timema. Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Date limiteLe délai de réception des offres était de 2023-07-17. L'appel d'offres a été publié le 2023-06-12.
FournisseursLes fournisseurs suivants sont mentionnés dans les décisions d'attribution ou dans d'autres documents relatifs aux marchés publics :
- • BGI
- • Genewiz France
- • INRAE
Historique des marchés publics
| Date | Document |
|---|---|
| 2023-06-12 | Avis de marché |
| 2023-07-12 | Informations complémentaires |
| 2023-12-14 | Avis d'attribution de marché |
Avis de marché (2023-06-12)
Objet
Champ d'application du marché
Titre: Services de laboratoire de recherche
Numéro de référence: 2023-CEFE-02
Brève description:
“L'objet du présent accord-cadre est de produire des ressources génétiques et des ensembles de données pour les espèces Timema. Il comprend le reséquençage...”
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Métadonnées de l'avis
Langue originale: français 🗣️
Type de document: Avis de marché
Nature du marché: Services
Réglementation: Union européenne
Vocabulaire commun pour les marchés publics (CPV)
Code: Services de laboratoire de recherche 📦
Code CPV supplémentaire: Services de laboratoire de recherche 📦
Lieu d'exécution
Région NUTS: Hérault 🏙️
Procédure
Type de procédure: Procédure ouverte
Type de soumission: Soumission pour tous les lots
Critères d'attribution
Offre la plus économique
Pouvoir adjudicateur
Identité
Pays: France 🇫🇷
Type de pouvoir adjudicateur: Organisme de droit public
Nom du pouvoir adjudicateur: CNRS Délégation Occitanie Est
Adresse postale: 1919 route de Mende
Code postal: 34293
Commune postale: Montpellier cedex 5
Contact
Adresse Internet: https://www.occitanie-est.cnrs.fr/ 🌏
Courrier électronique: achatsdr13@dr13.cnrs.fr 📧
URL des documents: https://www.marches-publics.gouv.fr/?page=Entreprise.EntrepriseAdvancedSearch&AllCons&id=2287836&orgAcronyme=f2h 🌏
URL pour la participation: https://www.marches-publics.gouv.fr/?page=Entreprise.EntrepriseAdvancedSearch&AllCons&id=2287836&orgAcronyme=f2h 🌏
Référence
Dates
Date d'envoi: 2023-06-12 📅
Date limite de soumission: 2023-07-17 📅
Date de publication: 2023-06-16 📅
Identifiants
Numéro d'avis: 2023/S 115-355230
Numéro JO-S: 115
Objet
Champ d'application du marché
Valeur totale estimée: 250 000 EUR 💰
Intitulé du lot: Reséquençage de génomes entiers de phasmes du genre Timema
Numéro du lot: 1
Brève description:
“Cette prestation vise à imputer les séquences du génome entier d'individus du genre Timema en utilisant un reséquençage profond (10x) du génome entier...”
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Durée de l'accord: 24 mois
Description des renouvellements:
“Le présent accord-cadre sera conclu pour une durée initiale de 12 mois à compter de sa notification.”
“Il est reconduit tacitement jusqu'à son terme. Le présent marché ne pourra faire l’objet que d’une seule reconduction La durée d’une période de reconduction...”
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Nom du projet ou programme financé par l’UE: Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Intitulé du lot: Production de génomes références d’espèces de phasmes du genre Timema
Numéro du lot: 2
Brève description:
“Le présent lot a pour objet le séquençage de génomes de référence avec un assemblage à l'échelle chromosomique et avec résolution des haplotypes. Nous...”
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Intitulé du lot: Séquençage de mécanismes épigénétiques de phasmes du genre Timema
Numéro du lot: 3
Brève description:
“La prestation vise à réaliser des tests épigénétiques chez T. cristinae à partir de populations de plantes hôtes différentes – qui définissent les écotypes....”
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“1) Le statut de méthylation de l'ADN en utilisant la technique WGBS ;”
“2) La carte d'accessibilité de la chromatine à haute résolution en utilisant la technique ATAC-seq;”
“3) L’organisation tridimensionnelle de la chromatine et une carte génomique des interactions entre les loci utilisant la technique Hi-C;”
“4) Carte des modifications des histones à l'aide de ChIP-seq;”
“5) Des modèles d'expression utilisant la technique RNA-seq;”
“6) Évaluer la structure génétique qui sous-tend ces structures épigénétiques à l'aide du WGS. Nous fournirons les tissus d'insectes et le fournisseur de...”
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Intitulé du lot: Génotypage par séquençage des librairies hautes diversités de phasmes du genre Timema
Numéro du lot: 4
Brève description:
“L’objet du présent contrat est de génotyper par séquençage des individus de l'espèce Timema cristinae. Nous fournirons au titulaire des librairies prêtes....”
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Lieu d'exécution
Site principal ou lieu d'exécution:
“CENTRE D’ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE – UMR 5175”
“1919, Route de Mende”
“34293 MONTPELLIER”
Informations juridiques, économiques, financières et techniques
Conditions de participation
Habilitation à exercer l'activité professionnelle:
“Se référer au Dossier de Consultation des Entreprises (DCE).”
Procédure
Base juridique: 32014L0024
Nombre de participants à envisager: 4
Heure limite de réception des offres: 11:00
Langues dans lesquelles les offres ou les demandes de participation peuvent être présentées: français 🗣️
Période de validité de l'offre: 4 mois
Date d'ouverture des offres: 2023-07-17 📅
Heure d'ouverture des offres: 11:00
Pouvoir adjudicateur
Contact
Point de contact: SFAC Pôle achats
Adresse du profil d'acheteur: http://www.marches-publics.gouv.fr 🌏
URL des documents: https://www.marches-publics.gouv.fr/?page=Entreprise.EntrepriseAdvancedSearch&AllCons&id=2287836&orgAcronyme=f2h 🌏
Informations complémentaires
Organe de révision
Nom: Tribunal administratif de Montpellier
Adresse postale: 6 rue Pitot
Commune postale: Montpellier
Code postal: 34063
Pays: France 🇫🇷
Téléphone: +33 467548100 📞
Courrier électronique: greffe.ta-montpellier@juradm.fr 📧
Fax: +33 467548156 📠
Adresse Internet: http://montpellier.tribunal-administratif.fr/ 🌏
Informations sur les délais d'introduction des recours:
“• Référé précontractuel prévu aux articles L. 551-1à L. 551-12 du code de justice administrative (CJA), pouvant être introduit depuis le début de la...”
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“• Référé contractuel prévu aux articles L. 551-13 à L. 551-23 du CJA, pouvant être exercé dans les délais prévus à l'article R. 551-7 du CJA ;”
“• Recours de pleine juridiction contestant la validité du marché dans un délai de 2 mois à compter de l'accomplissement des mesures de publicité appropriées...”
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Service auprès duquel des informations sur la procédure de recours peuvent être obtenues
Nom: Tribunal administratif de Montpellier
Adresse postale: 6 rue Pitot
Commune postale: Montpellier
Code postal: 34063
Pays: France 🇫🇷
Téléphone: +33 467548100 📞
Courrier électronique: greffe.ta-montpellier@juradm.fr 📧
Fax: +33 467548156 📠
Adresse Internet: http://montpellier.tribunal-administratif.fr/ 🌏
Source: OJS 2023/S 115-355230 (2023-06-12)
Objet
Champ d'application du marché
Titre: Services de laboratoire de recherche
Numéro de référence: 2023-CEFE-02
Brève description:
“L'objet du présent accord-cadre est de produire des ressources génétiques et des ensembles de données pour les espèces Timema. Il comprend le reséquençage...”
Métadonnées de l'avis
Langue originale: français 🗣️
Type de document: Avis de marché
Nature du marché: Services
Réglementation: Union européenne
Vocabulaire commun pour les marchés publics (CPV)
Code: Services de laboratoire de recherche 📦
Code CPV supplémentaire: Services de laboratoire de recherche 📦
Lieu d'exécution
Région NUTS: Hérault 🏙️
Procédure
Type de procédure: Procédure ouverte
Type de soumission: Soumission pour tous les lots
Critères d'attribution
Offre la plus économique
Pouvoir adjudicateur
Identité
Pays: France 🇫🇷
Type de pouvoir adjudicateur: Organisme de droit public
Nom du pouvoir adjudicateur: CNRS Délégation Occitanie Est
Adresse postale: 1919 route de Mende
Code postal: 34293
Commune postale: Montpellier cedex 5
Contact
Adresse Internet: https://www.occitanie-est.cnrs.fr/ 🌏
Courrier électronique: achatsdr13@dr13.cnrs.fr 📧
URL des documents: https://www.marches-publics.gouv.fr/?page=Entreprise.EntrepriseAdvancedSearch&AllCons&id=2287836&orgAcronyme=f2h 🌏
URL pour la participation: https://www.marches-publics.gouv.fr/?page=Entreprise.EntrepriseAdvancedSearch&AllCons&id=2287836&orgAcronyme=f2h 🌏
Référence
Dates
Date d'envoi: 2023-06-12 📅
Date limite de soumission: 2023-07-17 📅
Date de publication: 2023-06-16 📅
Identifiants
Numéro d'avis: 2023/S 115-355230
Numéro JO-S: 115
Objet
Champ d'application du marché
Valeur totale estimée: 250 000 EUR 💰
Intitulé du lot: Reséquençage de génomes entiers de phasmes du genre Timema
Numéro du lot: 1
Brève description:
“Cette prestation vise à imputer les séquences du génome entier d'individus du genre Timema en utilisant un reséquençage profond (10x) du génome entier...”
Durée de l'accord: 24 mois
Description des renouvellements:
“Le présent accord-cadre sera conclu pour une durée initiale de 12 mois à compter de sa notification.”
“Il est reconduit tacitement jusqu'à son terme. Le présent marché ne pourra faire l’objet que d’une seule reconduction La durée d’une période de reconduction...”
Nom du projet ou programme financé par l’UE: Cet accord-cadre est exécuté dans le cadre du projet ERC EE-Dynamics « Dynamics of eco-evolutionary systems » (PI P. Nosil).
Intitulé du lot: Production de génomes références d’espèces de phasmes du genre Timema
Numéro du lot: 2
Brève description:
“Le présent lot a pour objet le séquençage de génomes de référence avec un assemblage à l'échelle chromosomique et avec résolution des haplotypes. Nous...”
Intitulé du lot: Séquençage de mécanismes épigénétiques de phasmes du genre Timema
Numéro du lot: 3
Brève description:
“La prestation vise à réaliser des tests épigénétiques chez T. cristinae à partir de populations de plantes hôtes différentes – qui définissent les écotypes....”
“1) Le statut de méthylation de l'ADN en utilisant la technique WGBS ;”
Afficher plus (5)
“2) La carte d'accessibilité de la chromatine à haute résolution en utilisant la technique ATAC-seq;”
“3) L’organisation tridimensionnelle de la chromatine et une carte génomique des interactions entre les loci utilisant la technique Hi-C;”
“4) Carte des modifications des histones à l'aide de ChIP-seq;”
“5) Des modèles d'expression utilisant la technique RNA-seq;”
“6) Évaluer la structure génétique qui sous-tend ces structures épigénétiques à l'aide du WGS. Nous fournirons les tissus d'insectes et le fournisseur de...”
Numéro du lot: 4
Brève description:
“L’objet du présent contrat est de génotyper par séquençage des individus de l'espèce Timema cristinae. Nous fournirons au titulaire des librairies prêtes....”
Lieu d'exécution
Site principal ou lieu d'exécution:
“CENTRE D’ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE – UMR 5175”
“1919, Route de Mende”
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“34293 MONTPELLIER”
Informations juridiques, économiques, financières et techniques
Conditions de participation
Habilitation à exercer l'activité professionnelle:
“Se référer au Dossier de Consultation des Entreprises (DCE).”
Procédure
Base juridique: 32014L0024
Nombre de participants à envisager: 4
Heure limite de réception des offres: 11:00
Langues dans lesquelles les offres ou les demandes de participation peuvent être présentées: français 🗣️
Période de validité de l'offre: 4 mois
Date d'ouverture des offres: 2023-07-17 📅
Heure d'ouverture des offres: 11:00
Pouvoir adjudicateur
Contact
Point de contact: SFAC Pôle achats
Adresse du profil d'acheteur: http://www.marches-publics.gouv.fr 🌏
URL des documents: https://www.marches-publics.gouv.fr/?page=Entreprise.EntrepriseAdvancedSearch&AllCons&id=2287836&orgAcronyme=f2h 🌏
Informations complémentaires
Organe de révision
Nom: Tribunal administratif de Montpellier
Adresse postale: 6 rue Pitot
Commune postale: Montpellier
Code postal: 34063
Pays: France 🇫🇷
Téléphone: +33 467548100 📞
Courrier électronique: greffe.ta-montpellier@juradm.fr 📧
Fax: +33 467548156 📠
Adresse Internet: http://montpellier.tribunal-administratif.fr/ 🌏
Informations sur les délais d'introduction des recours:
“• Référé précontractuel prévu aux articles L. 551-1à L. 551-12 du code de justice administrative (CJA), pouvant être introduit depuis le début de la...”
“• Référé contractuel prévu aux articles L. 551-13 à L. 551-23 du CJA, pouvant être exercé dans les délais prévus à l'article R. 551-7 du CJA ;”
Afficher plus (1)
“• Recours de pleine juridiction contestant la validité du marché dans un délai de 2 mois à compter de l'accomplissement des mesures de publicité appropriées...”
Nom: Tribunal administratif de Montpellier
Adresse postale: 6 rue Pitot
Commune postale: Montpellier
Code postal: 34063
Pays: France 🇫🇷
Téléphone: +33 467548100 📞
Courrier électronique: greffe.ta-montpellier@juradm.fr 📧
Fax: +33 467548156 📠
Adresse Internet: http://montpellier.tribunal-administratif.fr/ 🌏
Source: OJS 2023/S 115-355230 (2023-06-12)
Informations complémentaires (2023-07-12)
Objet
Métadonnées de l'avis
Type de document: Informations complémentaires
Référence
Dates
Date d'envoi: 2023-07-12 📅
Date limite de soumission: 2023-07-24 📅
Date de publication: 2023-07-17 📅
Identifiants
Numéro d'avis: 2023/S 135-429840
Se réfère à l'avis: 2023/S 115-355230
Numéro JO-S: 135
Source: OJS 2023/S 135-429840 (2023-07-12)
Objet
Métadonnées de l'avis
Type de document: Informations complémentaires
Référence
Dates
Date d'envoi: 2023-07-12 📅
Date limite de soumission: 2023-07-24 📅
Date de publication: 2023-07-17 📅
Identifiants
Numéro d'avis: 2023/S 135-429840
Se réfère à l'avis: 2023/S 115-355230
Numéro JO-S: 135
Source: OJS 2023/S 135-429840 (2023-07-12)
Avis d'attribution de marché (2023-12-14)
Objet
Champ d'application du marché
Valeur totale du marché: 600 000 EUR 💰
Métadonnées de l'avis
Type de document: Avis d'attribution de marché
Réglementation: Union européenne, avec participation des pays de l'AMP
Procédure
Type de soumission: Sans objet
Pouvoir adjudicateur
Contact
Courrier électronique: dr13.achats@dr13.cnrs.fr 📧
Référence
Dates
Date d'envoi: 2023-12-14 📅
Date de publication: 2023-12-19 📅
Identifiants
Numéro d'avis: 2023/S 244-767047
Numéro JO-S: 244
Informations complémentaires
“Les recours susceptibles d’être introduits à l’encontre de la procédure ou du marché, ainsi que sur les délais d’introduction de ces recours figurent à la...”
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Procédure
Critères d'attribution
Critère de qualité (nom): Qualité de séquençage et compétences techniques
Critère de qualité (pondération): 60
Critère de qualité (nom): Délai de livraison
Critère de qualité (pondération): 10
Critère de qualité (nom): Valeur environnementale
Critère de qualité (pondération): 5
Prix (pondération): 25
Critère de qualité (pondération): 15
Prix (pondération): 20
Critère de qualité (pondération): 65
50
20
Attribution du marché
Date de conclusion du contrat: 2023-12-14 📅
Nom: Inrae
Adresse postale: chemin de Borde Rouge
Commune postale: Castanet tolosan
Code postal: 31326
Pays: France 🇫🇷
Haute-Garonne 🏙️
Valeur totale du marché: 200 000 EUR 💰
Nom: Bgi
Adresse postale: No 16 Dai Fu Street
Commune postale: Tai Po
Pays: R.A.S. chinoise de Hong Kong 🇭🇰
Nom: GENEWIZ France
Adresse postale: 75002
Commune postale: Paris
Pays: Paris 🏙️
Informations sur les appels d'offres
Nombre d'offres reçues: 8
3
5
Référence
Informations complémentaires
“Les recours susceptibles d’être introduits à l’encontre de la procédure ou du marché, ainsi que sur les délais d’introduction de ces recours figurent à la...”
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“La date de signature du marché pour le lot n°1 est le 12.12.2023 ; pour le lot n°2, la signature est en date du 13.12.2023 et pour le lot n°4, la signature...”
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“La date de notification de l'ensemble des lots aux titulaires est le 14.12.2023.”
“Le présent avis d'attribution correspond à l'accomplissement des mesures de publicité appropriées au sens de la décision Département de Tarn-et-Garonne (CE,...”
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“Le contrat est consultable dans le respect des secrets protégés par la loi n°78-753 du 17 juillet 1978 codifiée dans le livre III du code des relations...”
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Source: OJS 2023/S 244-767047 (2023-12-14)
Objet
Champ d'application du marché
Valeur totale du marché: 600 000 EUR 💰
Métadonnées de l'avis
Type de document: Avis d'attribution de marché
Réglementation: Union européenne, avec participation des pays de l'AMP
Procédure
Type de soumission: Sans objet
Pouvoir adjudicateur
Contact
Courrier électronique: dr13.achats@dr13.cnrs.fr 📧
Référence
Dates
Date d'envoi: 2023-12-14 📅
Date de publication: 2023-12-19 📅
Identifiants
Numéro d'avis: 2023/S 244-767047
Numéro JO-S: 244
Informations complémentaires
“Les recours susceptibles d’être introduits à l’encontre de la procédure ou du marché, ainsi que sur les délais d’introduction de ces recours figurent à la...”
Procédure
Critères d'attribution
Critère de qualité (nom): Qualité de séquençage et compétences techniques
Critère de qualité (pondération): 60
Critère de qualité (nom): Délai de livraison
Critère de qualité (pondération): 10
Critère de qualité (nom): Valeur environnementale
Critère de qualité (pondération): 5
Prix (pondération): 25
Critère de qualité (pondération): 15
Prix (pondération): 20
Critère de qualité (pondération): 65
50
20
Attribution du marché
Date de conclusion du contrat: 2023-12-14 📅
Nom: Inrae
Adresse postale: chemin de Borde Rouge
Commune postale: Castanet tolosan
Code postal: 31326
Pays: France 🇫🇷
Haute-Garonne 🏙️
Valeur totale du marché: 200 000 EUR 💰
Nom: Bgi
Adresse postale: No 16 Dai Fu Street
Commune postale: Tai Po
Pays: R.A.S. chinoise de Hong Kong 🇭🇰
Nom: GENEWIZ France
Adresse postale: 75002
Commune postale: Paris
Pays: Paris 🏙️
Informations sur les appels d'offres
Nombre d'offres reçues: 8
3
5
Référence
Informations complémentaires
“Les recours susceptibles d’être introduits à l’encontre de la procédure ou du marché, ainsi que sur les délais d’introduction de ces recours figurent à la...”
“La date de signature du marché pour le lot n°1 est le 12.12.2023 ; pour le lot n°2, la signature est en date du 13.12.2023 et pour le lot n°4, la signature...”
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“La date de notification de l'ensemble des lots aux titulaires est le 14.12.2023.”
“Le présent avis d'attribution correspond à l'accomplissement des mesures de publicité appropriées au sens de la décision Département de Tarn-et-Garonne (CE,...”
“Le contrat est consultable dans le respect des secrets protégés par la loi n°78-753 du 17 juillet 1978 codifiée dans le livre III du code des relations...”
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