Construction de banques ADN et séquençage haut-débit de type short ou long reads

INRAE de Montpellier

La consultation a pour objet trois types de prestations définis comme suit:
— la constitution de banques et le reséquençage de type Illumina de génomes complets d'insectes par une approche «shotgun» sur des échantillons individuels;
— la constitution de banques et le reséquençage de type Illumina de génomes complets d'insectes par une approche «shotgun» sur des échantillons regroupés en pools;
— l'extraction d'ADN de haut poids moléculaire, la construction de banques pour le séquençage «long reads» basé sur la technologie SMRT (Single Molecule Real Time Technology) de type PACBIO Sequel II.

Date limite

Le délai de réception des offres était de 2021-08-11. L'appel d'offres a été publié le 2021-07-09.

Fournisseurs

Les fournisseurs suivants sont mentionnés dans les décisions d'attribution ou dans d'autres documents relatifs aux marchés publics :

Qui ? Qu'est-ce que c'est ? Où ?
Historique des marchés publics
Date Document
2021-07-09 Avis de marché
2021-12-21 Avis d'attribution de marché
Avis de marché (2021-07-09)
Objet
Champ d'application du marché
Titre: Services de laboratoire de recherche
Numéro de référence: INRAE-C24-2021-017
Brève description:
La consultation a pour objet trois types de prestations définis comme suit: — la constitution de banques et le reséquençage de type Illumina de génomes complets d'insectes par une approche «shotgun» sur des échantillons individuels; — la constitution de banques et le reséquençage de type Illumina de génomes complets d'insectes par une approche «shotgun» sur des échantillons regroupés en pools; — l'extraction d'ADN de haut poids moléculaire, la construction de banques pour le séquençage «long reads» basé sur la technologie SMRT (Single Molecule Real Time Technology) de type PACBIO Sequel II.
Afficher plus
Métadonnées de l'avis
Langue originale: français 🗣️
Type de document: Avis de marché
Nature du marché: Services
Réglementation: Union européenne, avec participation des pays de l'AMP
Vocabulaire commun pour les marchés publics (CPV)
Code: Services de laboratoire de recherche 📦
Code CPV supplémentaire: Services de laboratoire de recherche 📦
Lieu d'exécution
Région NUTS: Hérault 🏙️

Procédure
Type de procédure: Procédure ouverte
Type de soumission: Soumission pour tous les lots
Critères d'attribution
Offre la plus économique

Pouvoir adjudicateur
Identité
Pays: France 🇫🇷
Type de pouvoir adjudicateur: Organisme de droit public
Nom du pouvoir adjudicateur: INRAE de Montpellier
Adresse postale: 2 place Pierre Viala
Code postal: 34060
Commune postale: Montpellier Cedex 2
Contact
Adresse Internet: http://www.inrae.fr/ 🌏
Courrier électronique: sam-montpellier@inrae.fr 📧
Téléphone: +33 499612003 📞
URL des documents: https://www.marches-publics.gouv.fr/ 🌏
URL pour la participation: https://www.marches-publics.gouv.fr/?page=entreprise.EntrepriseAdvancedSearch&AllCons&refConsultation=787408&orgAcronyme=s2d 🌏

Référence
Dates
Date d'envoi: 2021-07-09 📅
Date limite de soumission: 2021-08-11 📅
Date de publication: 2021-07-14 📅
Identifiants
Numéro d'avis: 2021/S 134-356954
Numéro JO-S: 134
Informations complémentaires
Le volume maximal attendu d'échantillons à séquencer, par an pour le lot 1 est le suivant 200 échantillons.

Objet
Champ d'application du marché
Brève description: La consultation a pour objet trois types de prestations définis comme suit:
— la constitution de banques et le reséquençage de type Illumina de génomes complets d'insectes par une approche «shotgun» sur des échantillons…
… individuels;
… regroupés en pools;
— l'extraction d'ADN de haut poids moléculaire, la construction de banques pour le séquençage «long reads» basé sur la technologie SMRT (Single Molecule Real Time Technology) de type PACBIO Sequel II.
Valeur totale estimée: 140 000 EUR 💰
Informations sur les lots: Néant.
Intitulé du lot: Reséquençage des génomes complets d'insectes non modèles par une approche «shotgun» sur échantillons individuels
Numéro du lot: 1
Brève description:
Reséquençage des génomes complets d'insectes non modèles par une approche «shotgun» sur échantillons individuels.
Valeur estimée hors TVA: 32 400 EUR 💰
Durée de l'accord: 48 mois
Description des renouvellements:
Chaque accord-cadre est conclu pour une durée de douze mois à compter de sa date de notification. Chaque accord-cadre est tacitement reconductible trois fois par périodes successives de douze mois sans que leur durée totale ne puisse excéder 48 mois (soit quatre ans).
Afficher plus
Description des options:
En application de l'article R. 2122-7 du code de la commande publique, l'acheteur se réserve la possibilité de conclure un marché négocié sans publicité ni mise en concurrence préalables pour la réalisation de prestations similaires à celles confiées au titulaire dans un délai de trois ans à compter de la notification du présent accord-cadre.
Afficher plus
Informations complémentaires:
Le volume maximal attendu d'échantillons à séquencer, par an pour le lot 1 est le suivant 200 échantillons.
Intitulé du lot: Reséquençage des génomes complets d'insectes non modèles par une approche «shotgun» sur échantillons regroupés (Pool-Seq)
Numéro du lot: 2
Brève description:
Reséquençage des génomes complets d'insectes non modèles par une approche «shotgun» sur échantillons regroupés (Pool-Seq).
Valeur estimée hors TVA: 27 000 EUR 💰
Informations complémentaires:
Le volume maximal attendu d'échantillons à séquencer, par an pour le lot 2 est le suivant 25 pools.
Intitulé du lot: Reséquençage des génomes complets d'insectes par l'approche long read basé sur la technologie SMRT de type PACBIO Sequel II CCS mode
Numéro du lot: 3
Brève description:
Reséquençage des génomes complets d'insectes par l'approche long read basé sur la technologie SMRT de type PACBIO Sequel II CCS mode.
Valeur estimée hors TVA: 81 120 EUR 💰
Informations complémentaires:
Le volume maximal attendu d'échantillons à séquencer, par an pour le lot 3, est le suivant: 80 échantillons.

Procédure
Base juridique: 32014L0024
Heure limite de réception des offres: 12:00
Langues dans lesquelles les offres ou les demandes de participation peuvent être présentées: anglais 🗣️
français 🗣️
Période de validité de l'offre: 4 mois
Date d'ouverture des offres: 2021-08-11 📅
Heure d'ouverture des offres: 14:00
Lieu: Montpellier.
Informations complémentaires:
Cette date est prévisionnelle. La séance d'ouverture des plis n'est pas publique.

Pouvoir adjudicateur
Identité
Numéro d'enregistrement national: 18007003901027
Contact
Adresse du profil d'acheteur: https://www.marches-publics.gouv.fr 🌏
URL des documents: https://www.marches-publics.gouv.fr/ 🌏
Adresse Internet: https://www.marches-publics.gouv.fr/ 🌏

Référence
Informations complémentaires
Le volume maximal attendu d'échantillons à séquencer, par an et par lot, est le suivant:
— lot 1: 200 échantillons;
— lot 2: 25 pools;
— lot 3: 80 échantillons.

Informations complémentaires
Organe de révision
Nom: Tribunal administratif de Montpellier
Adresse postale: 6 rue Pitot
Commune postale: Montpellier Cedex
Code postal: 34000
Pays: France 🇫🇷
Téléphone: +33 467548100 📞
Courrier électronique: greffe.ta-montpellier@juradm.fr 📧
Fax: +33 461547410 📠
Adresse Internet: http://montpellier.tribunal-administratif.fr/ 🌏
Informations sur les délais d'introduction des recours:
Précisions concernant les recours susceptibles d'être introduits à l'encontre de la procédure ou du marché, ainsi que sur les délais d'introduction de ces recours:
— référé précontractuel prévu aux articles L. 551-1 à L. 551-12 du Code de justice administrative (CJA), pouvant être introduit depuis le début de la procédure de passation jusqu'à la signature du marché;
— référé contractuel prévu aux articles L. 551-13 à L. 551-23 du CJA, pouvant être exercé dans les délais prévus à l'article R. 551-7 du CJA;
— recours de pleine juridiction contestant la validité du marché dans un délai de deux mois à compter de l'accomplissement des mesures de publicité appropriées au sens de la décision Département de Tarn-et-Garonne (CE, Ass., 4.4.2014, nº 358994). Ce recours en contestation de validité peut être assorti d'une demande tendant, sur le fondement de l'article L. 521-1 du code de justice administrative, à la suspension de l'exécution du contrat.
Afficher plus
Service auprès duquel des informations sur la procédure de recours peuvent être obtenues
Identique à : Organe de révision
Source: OJS 2021/S 134-356954 (2021-07-09)
Avis d'attribution de marché (2021-12-21)
Objet
Champ d'application du marché
Brève description:
la consultation a pour objet trois types de prestations définis comme suit : ? La constitution de banques et le re-séquençage de type Illumina de génomes complets d?insectes par une approche " shotgun " sur des échantillons individuels ; ? La constitution de banques et le re-séquençage de type Illumina de génomes complets d?insectes par une approche " shotgun " sur des échantillons regroupés en pools ; ? L?Extraction d?adn de haut poids moléculaire, la construction de banques pour le séquençage " long reads " basé sur la technologie SMRT (Single Molecule Real Time Technology) de type PACBIO Sequel II
Afficher plus
Valeur totale du marché: 562 080 EUR 💰
Métadonnées de l'avis
Type de document: Avis d'attribution de marché

Procédure
Type de soumission: Sans objet

Pouvoir adjudicateur
Identité
Nom du pouvoir adjudicateur: inrae de Montpellier
Contact
Téléphone: +33 0499612003 📞

Référence
Dates
Date d'envoi: 2021-12-21 📅
Date de publication: 2021-12-24 📅
Identifiants
Numéro d'avis: 2021/S 250-664062
Se réfère à l'avis: 2021/S 134-356954
Numéro JO-S: 250
Informations complémentaires
les recours susceptibles d'être introduits à l'encontre de la procédure ou du marché, ainsi que sur les délais d'introduction de ces recours figurent à la rubrique Vi.4.3 de l'aap (formulaire européen).la date de signature des accords-cadre issus de la présente procédure est le 17 Novembre 2021 et la date de notification de chaque marché à leur titulaire est le 25 Novembre 2021. Le présent avis d'attribution correspond à l'accomplissement des mesures de publicité appropriées au sens de la décision Département de Tarn-Et-Garonne (CE, Ass., 4 avril 2014, no358994). Le contrat est consultable dans le respect des secrets protégés par la loi no78-753 du 17 juillet 1978 codifiée dans le livre III du code des relations entre le public et l'administration, sur place à l'adresse indiquée à la rubrique 1.1, après une demande écrite adressée par courriel au service achats & marché et uniquement sur prise de rendez-vous du lundi au vendredi de 9:30à 11:30 et de 14:30 à 16:00, hors jours fériés et jours de fermeture du site
Afficher plus

Objet
Champ d'application du marché
Intitulé du lot: re-Séquençage des génomes complets dinsectes non modèles par une approche " shotgun " sur échantillons individuels
Brève description:
re-Séquençage des génomes complets dinsectes non modèles par une approche " shotgun " sur échantillons individuels
Description des options:
en application de l'article R.2122-7 du code de la commande publique, l'acheteur se réserve la possibilité de conclure un marché négocié sans publicité ni mise en concurrence préalables pour la réalisation de prestations similaires à celles confiées au titulaire dans un délai de 3 ans à compter de la notification du présent accord-cadre
Afficher plus
Intitulé du lot: re-Séquençage des génomes complets d?insectes non modèles par une approche " shotgun " sur échantillons regroupés (Pool-Seq)
Brève description:
re-Séquençage des génomes complets d?insectes non modèles par une approche " shotgun " sur échantillons regroupés (Pool-Seq)
Intitulé du lot: re-Séquençage des génomes complets d?insectes par l?approche long read basé sur la technologie SMRT de type PACBIO Sequel ii ccs mode
Brève description:
re-Séquençage des génomes complets d?insectes par l?approche long read basé sur la technologie SMRT de type PACBIO Sequel ii ccs mode

Procédure
Critères d'attribution
Critère de qualité (nom): Valeur technique
Critère de qualité (pondération): 40
Critère de qualité (nom): Délais d'exécution des prestations
Critère de qualité (pondération): 20
Prix (pondération): 40

Attribution du marché
Date de conclusion du contrat: 2021-11-25 📅
Nom: novogene (uk) company ltd
Adresse postale: 55 Baker Street
Commune postale: Londres
Code postal: W1U7EU
Pays: Royaume-Uni 🇬🇧
Camden and City of London 🏙️
Adresse Internet: https://en.novogene.com/ 🌏
Valeur totale du marché: 129 600 EUR 💰
Nom: macrogen europe bv
Adresse postale: meibergdreef 57
Commune postale: Amsterdam
Code postal: 1105BA
Pays: Pays-Bas 🇳🇱
Groot-Amsterdam 🏙️
Adresse Internet: https://dna.macrogen-europe.com/eng/ 🌏
Valeur totale du marché: 108 000 EUR 💰
324 480 EUR 💰
Informations sur les appels d'offres
Nombre d'offres reçues: 5
3

Informations complémentaires
Organe de révision
Nom: tribunal Administratif de Montpellier
Téléphone: +33 0467548100 📞
Fax: +33 0461547410 📠
Informations sur les délais d'introduction des recours:
précisions concernant les recours susceptibles d'être introduits à l'encontre de la procédure ou du marché, ainsi que sur les délais d'introduction de ces recours : - référé précontractuel prévu aux articles L. 551-1à L. 551-12 du code de justice administrative (Cja), pouvant être introduit depuis le début de la procédure de passation jusqu'à la signature du marché ;- référé contractuel prévu aux articles L. 551-13 à L. 551-23 du CJA, pouvant être exercé dans les délais prévus à l'article R. 551-7 du CJA ;- recours de pleine juridiction contestant la validité du marché dans un délai de 2 mois à compter de l'accomplissement des mesures de publicité appropriées au sens de la décision Département de Tarn-Et-Garonne (CE, Ass., 4 avril 2014, no358994). Ce recours en contestation de validité peut être assorti d'une demande tendant, sur le fondement de l'article L. 521-1 du code de justice administrative, à la suspension de l'exécution du contrat
Afficher plus
Service auprès duquel des informations sur la procédure de recours peuvent être obtenues
Adresse postale: 6 Rue Pitot
Fax: +33 0467547410 📠
Source: OJS 2021/S 250-664062 (2021-12-21)
Nouveaux marchés dans des catégories connexes 🆕
Recherches connexes 🔍
Région:
France Occitanie Languedoc-Roussillon Hérault
Fournisseurs:
Macrogen Europe BV novogene (Uk) Company LTD
Produits/services:
Services de recherche et développement et... Services de recherche et développement... Services de recherche Services de laboratoire de recherche